FOTOS ANTIGUAS DE ZARAUZ
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El convento fue fundado en 1610 por Don Juan de Manzisidor, natural de Zarautz; secretario y consejero de Felipe III en Flandes. Ocupado por los frailes en 1617, fue utilizado como hospital y almacén por los franceses durante la guerra de Convención quienes posteriormente lo saquearon llevándose una gran cantidad de reliquias traídas desde Flandes por su fundador.
En 1830 fue reformado y en 1959 se arnplía la nave de la iglesia con la anexión de una ala del claustro y del patio y se construyó la fachada actual.
El conjunto está formado por la Iglesia, Convento y Colegio. La primera tiene una planta de cruz latina con los brazos del crucero cortos y anchos. Las tres naves están cubiertas con bóvedas de arista excepto en el centro del crucero que se cubre con bóveda vaída. La nave principal es más ancha y larga que las laterales que quedan divididas por grandes pilares rectangulares de distintos tamaños. Las numerosas reformas realizadas hace que sea un conjunto complejo de dificil adscribción estilística.
Es un edificio que no destaca sobremanera en lo artístico pero guarda su propia personalidad conforme al estilo franciscano.
En el interior aparece el retablo central y los colaterales. El primero realizado po J. Ruiz de Larrinaga en 1828 se estructura en dos pilastras, un par de columnas de capitel corintio y otras dos que soportan un entablamento con hornacina y la imagen principal del Bautista. A sus lados dos esculturas que representan a los santos franciscanos. Corona una alegoría de la divinidad a modo de ojo frontal. Merece destacar la existencia en su interior de un tríptico flamenco firmado por Antonio Blocklandt en 1577. Está pintado al óleo sobre tabla donde se representan las Pascuas de Natividad (puerta izquierda), Pentecostés (tabla central) y Resurrección (puerta derecha)
El Convento de S. Juan Bautista tuvo carácter de Casa de Recolección, con régimen religioso de vida estricta, hasta que fue cerrado en 1840 por las leyes de Exclaustración. Entretanto había sido Colegio de Misioneros, desde 1746. Como consecuencia de ello, este Colegio dispuso de una Biblioteca amplia que reunió sermonarios de la época, obras de espiritualidad, y también valiosos originales inéditos de la literatura vasca (Etxeberri de Sara, J. A. Moguel y otros.)
Tempranamente restaurado (1867), lo fue definitivamente tras la última Guerra Carlista, y vino a ser la base institucional sobre la que se gestó la Restauración general de la Provincia de Arantzazu. Con algún breve paréntesis, fue sede de la Curia Provincial hasta 1925.
En el siglo XX, la incidencia pastoral, educativa y social de las iniciativas nacidas en este Convento de frailes ha sido notabílisima en Zarauz y su comarca. El creciente complejo educativo franciscano, iniciado en 1911, ha abarcado enseñanzas regladas y no regladas y ha polarizado en sí, no sólo el trabajo de un personal religioso amplio, sino también colaboraciones muy variadas de la población local.
La Fraternidad actual (2004) consta de 18 religiosos que toman parte en la enseñanza, en el culto y actividades del Centro de Culto en la propia iglesia y colaboran en el plan pastoral conjunto de la localidad y comarca (Varias fuentes)